Экологическое просвещение и экотуризм;
Охрана и надзор за соблюдением природоохранного законодательства;
Сопровождение деятельности по регулированию лесных и земельных отношений;
Сохранение биоразнообразия и научная деятельность;
Международное сотрудничество;
Информационно-аналитическое сопровождение финансово-экономического обеспечения системы ООПТ
Научно-исследовательские работы;
Подготовка научно-методических документов;
Координация деятельности Комиссии (КК РФ), Рабочих групп (по редким видам), иных совещательных органов;
Подготовка аналитических обзоров, справок;
Сопровождение ведения Госкадастра ООПТ;
Сопровождение подготовки списков КК РФ и иных НПА в сфере редких видов;
Участие в реализации госзаданий Минприроды России
Научно-методическое обеспечение деятельности ФГБУ ООПТ по основным направлениям (научному, экомониторингу, охране, экопросу, экотуризму, финансово-хозяйственной деятельности, и т.п.);
Координация деятельности ФГБУ по:
- подготовке и повышению квалификации кадров для заповедной системы;
- подготовке землеустроительной, лесоустроительной документации, постановке на земкадастровый учет, ведении бухучета и т.п.