Фауна национального парка в целом характерна для Южного Урала. Обычными видами являются медведь, волк, лиса, кабан, заяц-беляк, лось, куница и другие. Кроме того, несколько видов, встречающихся в границах ООПТ, занесены в список Международного союза охраны природы - это речная выдра, садовая соня, прудовая ночница, европейская норка.
Благодаря активной природоохранной работе, в национальном парке стала расти численность косули, кабана, лося, куницы. Вновь появился и активно стал осваивать водотоки бобр. Численность медведя также значительно возросла в последние годы и встречи с хищниками стали регулярным явлением.
В национальном парке «Башкирия» активно развивается туризм. В рамках туристских маршрутов ООПТ можно взойти на вершины гор Таллы и Бейек-Тау, посетить Кутукское урочище – царство пещер и карста, сплавиться по реке Нургуш, отдохнуть на берегу Нургушского водохранилища. В течение лета 2021-го года национальный парк посетили более ста тысяч туристов.
Росзаповедцентр Минприроды России поздравляет коллектив национального парка с юбилеем особо охраняемой природной территории!